Площадь основного помещения музея составит 11 тысяч квадратных метров; также в комплекс войдут складские помещения и центр реставрации памятников культуры. В коллекции будут собраны более 300 тысяч письменных источников из родового архива Конфуция и его потомков, который сохранился со времен династии Мин, 8 тысяч предметов украшений и одежды династий Мин и Цин, а также 40 тысяч уникальных книг династии Сун. 

 

Основную экспозицию музея разделят на шесть частей: "Эпоха Конфуция", "Жизнь Конфуция", "Мудрость Конфуция", "Конфуций и китайская цивилизация", "Конфуций и мировая цивилизация" и "Вечный Конфуций".